Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FNTAP49354 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FNTAP49354 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FNTAP49354 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FNTAP49354 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FNTAP49354 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FNTAP49354 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FNTAP49354 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms