Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NR4A2P43354 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms