Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDF5P43026 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDF5P43026 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDF5P43026 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GDF5P43026 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDF5P43026 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms