Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD10P28358 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms