Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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