Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB1P20618 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms