Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNNI3P19429 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNNI3P19429 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms