Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD53P19397 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD53P19397 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD53P19397 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD53P19397 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD53P19397 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD53P19397 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD53P19397 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD53P19397 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD53P19397 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD53P19397 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD53P19397 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms