Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ODC1P11926 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODC1P11926 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODC1P11926 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODC1P11926 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms