Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOA1P02647 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOA1P02647 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms