Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTA1P02549 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms