Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPBD1B2RD01 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms