Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSDA5PKW4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSDA5PKW4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms