Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C5orf49A4QMS7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C5orf49A4QMS7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms