Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF8Q9UPP1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms