Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
L1RE1Q9UN81 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
L1RE1Q9UN81 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms