Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC2LQ9UL33 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms