Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFT172Q9UG01 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFT172Q9UG01 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms