Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHRF1Q9P1Y6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHRF1Q9P1Y6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms