Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG3Q9NT62 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms