Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMURF2Q9HAU4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms