Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL4Q9C0H6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms