Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTNAP4Q9C0A0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms