Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD1Q9BXT4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms