Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COL25A1Q9BXS0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COL25A1Q9BXS0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms