Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms