Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIRIP3Q9BW71 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIRIP3Q9BW71 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms