Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms