Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERPUD2Q9BSE4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms