Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF559Q9BR84 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF559Q9BR84 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms