Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms