Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPTSSAQ969W0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms