Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAVIN3Q969G5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms