Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD1Q8NHV4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms