Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA6DQ8NFY4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms