Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TTC29Q8NA56 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TTC29Q8NA56 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms