Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VPS8Q8N3P4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS8Q8N3P4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms