Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC141Q6ZP82 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms