Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C16orf54Q6UWD8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C16orf54Q6UWD8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms