Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VIRMAQ69YN4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIRMAQ69YN4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms