Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms