Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALFQ53S48 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms