Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms