Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Q1T7F1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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