Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSRP2Q16527 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSRP2Q16527 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms