Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms