Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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UBE3CQ15386 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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UBE3CQ15386 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE3CQ15386 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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UBE3CQ15386 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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UBE3CQ15386 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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UBE3CQ15386 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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UBE3CQ15386 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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UBE3CQ15386 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE3CQ15386 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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