Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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