Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SCARF1Q14162 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCARF1Q14162 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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