Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
RASGRF1Q13972 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RASGRF1Q13972 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms